本发明涉及一种配电网时间同步系统及方法，特别涉及一种基于PTNEPON通信系统的智能配电网时间同步系统及方法。包括精确时钟源装置，精确时钟源装置的主时钟端口通过IEC61588协议连接局端PTN设备的从时钟端口，局端PTN设备的主时钟端口依次与多个变电站中的PTN设备级联形成一个环形结构，所述的变电站中的PTN设备的主时钟端口连接路由器，路由器通过交换机连接OLT设备的从时钟端口，OLT设备通过光纤连接ONU设备，ONU设备的主时钟端口与配电终端相连接。本发明只将GPS用作时钟源，应用IEC61588技术，通过通信系统将精确时间逐级传递，使整个智能配电网实现时间同步，时间精度理论上优于1微秒，对GPS的依赖性小，能够满足智能配电网对时间同步的要求，结构简单，实用性高。
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