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[00275040]一种基于GPU的LD tagSNPs并行选择方法

交易价格: 面议

类型: 发明专利

技术成熟度: 正在研发

专利所属地:中国

专利号:CN201310054307.5

交易方式: 完全转让 许可转让 技术入股

联系人: 中南大学

所在地:湖南长沙市

服务承诺
产权明晰
资料保密
对所交付的所有资料进行保密
如实描述
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技术详细介绍

  本发明公开了一种基于GPU的LD tagSNPs并行选择方法(专利号201310054307.5),其特征在于,包括以下步骤:步骤一,筛选过滤LD数据:该步骤用于从标准LD数据中提取出满足阈值条件的LD数据记录,并形成集合SetLD;步骤二,无向图构造:该步骤将集合SetLD构造成一个无向图G;步骤三,子图划分:将无向图G划分为独立的子图,并形成子图集合Setsub-G步骤四,tagSNPs选择:将步骤三中获得的Setsub-G输入到GPU的显存中,采用并行处理方法,获得tagSNPs选择结果。该基于GPU的LD tagSNPs并行选择方法处理效率高,能高效高速地挑选出数量相对较少的tagSNPs。

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