[00265840]一种基于树搜索和片段组装的蛋白质结构预测方法

交易价格： 面议

类型： 发明专利

技术成熟度： 正在研发

专利所属地：中国

专利号：CN201410138175.9

交易方式： 完全转让许可转让技术入股

联系人：浙江工业大学

所在地：浙江杭州市

服务承诺: 产权明晰; 资料保密
对所交付的所有资料进行保密; 如实描述

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技术详细介绍

一种基于树搜索和片段组装的蛋白质结构预测方法，包括以下步骤A1、获取蛋白质的pdb格式的文件并清洗出所需数据；A2、生成片段库；A3、选取力场模型；A4、采用Rosetta的score3能量函数；A5、将整个能量图景离散化，并将每层进一步离散化，分成单独的分块区，每次搜索根据能量的权重随机选取一个能量层，并在该能量层依概率选取一个分块区，如果分块区中包含有构象，采用片段组装方法，随机选取序列上的一个片段，然后在片段库中随机选取一个片段，替换序列上的目标片段，用蒙特卡洛准则来判断是否接受这个构象，如果接受则将它放入一个集合当中。本发明可以大大减少计算量和计算时间，保证搜索到能量较低的构象。

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