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类型: 非专利
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研究目标/论点/创新:癌症的发生和发展并不能通过单一基因或基因产物、单一通路或单一层次上的某些变化行为来解释。识别癌风险通路(Pathway)与相关组蛋白修饰(histone modification)对癌发病机制研究有重要意义。 本项目以挖掘癌症风险通路和识别出癌症相关如组蛋白等的风险因子为主要目标,融合模式识别方法、数据挖掘技术和生物信息学领域知识匹配技术,提出创新的基于分子谱(基因表达谱和蛋白质谱等)生物信息学分析的系列方法。 完成的主要内容包括:(1)基于组学的癌风险子通路识别SubpathwayMiner;(2)癌症相关组蛋白修饰改变的识别及分子功能分析;(3)基于功能数据库的癌症相关风险因子识别研究;(4)基于基因功能表达谱的复杂疾病分型与疾病遗传异质性分析;(5)疾病相关风险通路优化识别的软件平台:SubpathwayMiner;(6)人类组蛋白修饰数据库(HHMD)平台,同时,应用研究的系统方法于结肠癌、前列腺癌等疾病的研究。 社会经济效益:癌风险通路与相关癌症组蛋白修饰的识别及其多重生物标志物研究是进行癌机制研究的重要科学问题,也是后基因组计划最大的挑战之一。重大疾病的发生和发展伴随着不同分子谱(基因表达谱和蛋白质谱等)的时空表达,对于单一层面的基因表达和蛋白质谱,它们仅能够反应某一特定层面的信息,孤立地分析对于探索人类癌发生机理是十分有限的。揭示这一复杂体系,需对高通量生物谱进行集成分析。癌风险通路与癌相关组蛋白等分子因子识别方法研究,对预测患病风险,提高诊断及预后预测准确率,实施现代化医疗等具有重大意义和社会效益。 本项目研究成果以论文形式发表在国内外著名生命科学杂志《Nucleic Acids Research》(多篇,SCI影响因子:7.479)、《Bioinformatics》(SCI影响因子:5.039) 、《BMC Genomics》(SCI影响因子:4.328)、《BMC Systems Biology》(SCI影响因子:3.71),发表论文32篇,其中SCI 20 篇,累计SCI影响因子77余点。研制的多功能生物信息学平台(SubpathwayMiner; HHMD等),产生了很好的学术影响,取得了较好的经济和社会效益。
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