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[00332607]毛木耳白色突变菌株基因组学分析(面上)

交易价格: 面议

类型: 非专利

交易方式: 资料待完善

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技术详细介绍

项目通过前期的毛木耳基因组测序及后续的上海1号及川白耳1号基因组重测序,分析获得毛木耳基因组为71.6Mb,23个SSR序列,预测了16,604个基因,假基因(pseudogene)440个,注释基因16,484个,跨膜蛋白2618个,分泌蛋白1,385个。 毛木耳基因组突变方面,上海1号(SH1-1)SNP数量为611841个,川白耳1号(CBE1-1)SNP数量为619646个,全基因组SNP突变主要以T:A>C:G及C:G>T:A为主;川白耳1号独有的SNP位点数量为34482个;上海1号编码区InDel突变14845个,川白耳1号编码区InDel突变15211个;两个菌株InDel突变中以1bp的插入/删除突变为主,其次为2、3bp插入/删除突变;上海1号独有的InDel位点数量为7029个,川白耳1号独有的InDel位点数量为9733个,两个菌株共有交集117096个;上海1号注释到数据库的差异基因数目有12245个,川白耳1号有12280个。

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