[00306567]泛耐药肺炎克雷伯菌全基因组测序与比较基因组学研究
交易价格：
面议
类型：
非专利
技术成熟度：
正在研发
交易方式：
资料待完善
联系人：
朱健铭
所在地：浙江
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资料保密
对所交付的所有资料进行保密
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技术详细介绍
该项目为2012年杭州市科技计划引导项目（社会发展），项目编号：2012027。
肺炎克雷伯菌(Klebsiellapneumoniae，Kpn)是重要的条件致病菌和医院感染常见的病原体，可引起尿路感染、肺炎、败血症及软组织感染等疾病。近年来，随着抗菌药物的广泛使用，肺炎克雷伯菌的临床分离率和耐药性不断上升，尤为严重的是对碳青霉烯类耐药的肺炎克雷伯菌持续增加，给临床抗感染治疗带来了严峻的挑战。国内外对泛耐药的肺炎克雷伯菌尚无全基因组测序和比较基因组学研究报道。而对泛耐药的肺炎克雷伯菌进行全基因组测序和比较基因组学的研究，可以明确泛耐药肺炎克雷伯菌可能存在的全部耐药机制。
该项成果在国内外首次采用第二代高通量测序技术对泛耐药肺炎克雷伯菌临床分离株（JM45株）进行全基因组测序，获得了完整的基因组序列及两个质粒序列（已被美国国立生物信息中心收录，GenBank收录号分别为：CP006656、CP006657和CP006658）。采用生物信息学技术深入分析了泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株的耐药分子机制和耐药的遗传学背景，并与NCBI收录全基因组序列的其他6株肺炎克雷伯菌作了比较基因组学分析。发现肺炎克雷伯菌JM45株除携带4种已知的β-内酰胺酶基因（TEM-1、SHV-11、CTX-M-24、VEB-3）外，还在国内外首次发现携带4种新的β-内酰胺酶基因或β-内酰胺酶结构域序列(含2种金属β-内酰胺酶结构域蛋白序列)，阐明了泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株对头孢菌素类、碳青霉烯类等β-内酰胺类抗菌药物耐药的的分子机制。在国内外首次发现317156bp的pJM45-1耐药性质粒，并通过功能注释分析证实该质粒为可接合转移质粒，携带了抗菌药物耐药编码基因、重金属离子耐受编码基因、毒素编码基因和转座子、整合子以及插入序列等83个耐药相关编码基因，表明肺炎克雷伯菌JM45株pJM45-1质粒携带大量耐药元件，是该菌株进化为泛耐药的主要原因。该项成果还在国内外首次对单个看家基因分子进化分析法、MLST分型法与基因组系统学分析法进行菌株亲缘性关系分析的比较研究。提出了在菌株亲缘性关系分析中，基于全基因组序列信息的基因组系统学分析法优于单个基因序列的分子进化分析法和MLST分型法。
该项成果已发表研究论文9篇，并申请发明专利1件（CN104371916A）。
该项成果紧密联系临床，方法先进，结果可靠，结论可信。对泛耐药的肺炎克雷伯菌感染的防治以及新药研发具有重要的指导意义。为临床治疗泛耐药的肺炎克雷伯菌引起的感染和新药研发提供了理论基础，有望提高治疗效果，缩短治疗时间，加快病床周转率，减少患者的治疗费用，具有显著的社会经济效益。经查新和专家组鉴定其成果已达到同类研究的国内领先、国际先进水平。
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