[00303537]基于基因组测序的体细胞突变位点挖掘方法

交易价格： 面议

类型： 发明专利

技术成熟度： 正在研发

专利所属地：中国

专利号：CN201510357924.1

交易方式： 完全转让

联系人：华中农业大学

所在地：湖北武汉市

服务承诺: 产权明晰; 资料保密
对所交付的所有资料进行保密; 如实描述

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技术详细介绍

摘要：本发明公开了一种基于基因组测序的体细胞突变位点挖掘方法。本发明通过对野生型柚和突变型柚的各个组织的深度重测序，对得到的高质量的测序reads和甜橙基因组进行比对获得各组材料的单核苷酸多态性位点(SNP)。基于这些全基因组分布的SNP位点，对野生型柚和突变型柚设计case-control型的关联分析，得到突变相关的候选位点，对这些候选位点进行注释，并推测性状相关变异发生的染色体区域，最后利用Sanger测序方法对候选位点进行验证，获得了突变型柚的变异位点。该方法最大的优势在于低成本、周期短。完成一个突变体突变位点挖掘的成本在2万元左右，在3个月时间内可完成，体现了基因组前沿技术和柑橘传统育种研究的结合与创新探索。本发明还公开了所述方法的开发及应用。

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