本研究属于畜牧学科科动物遗传学研究领域。宁强马是产于秦岭南坡巴山北麓的嘉陵江上游和汉水流域，1990 年后，宁强马的数量急剧减少，面临种群灭绝的风险。，为保护这一珍贵遗传资源，开展宁强马遗传学方面的基础研究对于宁强马的保护和开发利用是非常必要的。本研究利用分子生物学技术从遗传多样性分析、起源进化及特色基因挖掘等方面对宁强马进行了系统研究。主要研究内容包括：（1）宁强矮马微卫星DNA 遗传多样性和线粒体DNA 遗传多样性分析，建立了宁强矮马遗传资源评价体系，发现宁强马具有丰富的遗传多样性。（2）基于线粒体DNA 和Y 染色体微卫星DNA 开展宁强马起源进化研究，弄清宁强马的起源，阐明宁强马的分子系统学地位。（3）利用分子标记技术和DNA 测序技术开展宁强马生长性状相关基因研究，筛选了宁强马体高性状相关的6个基因及相关SNPs，为宁强马的选育与开发利用提供新技术。（4）理论与实践结合，将研究成果应用于宁强良种繁育中心（国家宁强马保种场）宁强马保种、选育和开发的工作方案制定。宁强马体格小、格温顺、毛色多样，种质特征符合现代马业中旅游与娱乐的产业要求。因此，在宁强马遗传资源评价分析的基础上，揭示其起源、进化历程，弄清其在中国马乃至世界马品种系统地位，挖掘特色性状相关基因，将为宁强马的资源保护、品种选育和产业转型发展提供理论和技术支持。本研究共发表科研论文14 篇，其中CSCD 收录4 篇，