本实用新型公开了基质培分根区交替灌溉系统,包括:多个栽培槽,任一栽培槽包括,栽培槽本体,其为长方体结构,其底面沿其长度方向设有第一凹槽,与第一凹槽相连的两侧壁上设有与第一凹槽连通并竖直设置的第二凹槽;防水透气隔板,其竖直设于栽培槽本体的内部,防水透气隔板的两端卡设于第二凹槽内,底部卡设与第一凹槽内,顶部间隔设有多个缺口,其中,防水透气隔板与第一凹槽和第二凹槽的连接处通过凡士林密封;栽培槽本体的高度大于防水透气隔板的高度;栽培槽本体内的基质的高度小于等于防水透气隔板的高度;缺口的深度比待栽培植株的栽种深度大2‑3cm。本实用新型可将待栽培植株直接栽种于缺口内,无需人工分根,栽种效率高。