本实用新型涉及土壤样品采集技术领域,公开了一种土壤微生物样品采集装置,包括底座,所述底座顶部一侧固定连接有升降机构,所述底座顶部一侧设置有指示机构,所述升降机构一侧的底部设置有安拆机构,所述升降机构一侧的顶部固定连接有伺服电机一,所述安拆机构底部设置有采集机构,所述底座的顶部另一侧位于采集机构的前后两端均固定连接有夹持机构;所述升降机构包括电机盒,所述电机盒的底侧固定连接在底座的顶部一侧,所述电机盒的内部设置有伺服电机二。本实用新型中,通过升降机构和指示机构的配合,完成自动化定量采集,通过采集机构使得采集土壤样品储存在采集筒内部,过程无需接触外界环境,避免被污染的情况。