作物秸秆是全球储量丰富但未被有效利用的资源，我国秸秆资源总量约10亿吨/年，肥料化、饲料化、基料化、燃料化、原料化是主要利用途径，平均综合利用率约82%。但上述利用方式，存在秸秆转化产品附加值低、产业链短等问题。此外，仍有约1.8亿吨未被有效利用，秸秆焚烧时有发生，是部分地区季节性雾霾形成的重要原因。作物秸秆的高效清洁转化对农业可持续发展具有重要意义。目前国内外研究主要集中在秸秆生物质能转化方向，其中燃料乙醇和热解气化是研究热点。在燃料乙醇研究方面，预处理、纤维素酶、戊糖己糖共发酵是研究重点。项目组以清洁生产为核心思想，以全组份利用为目标，开展了12年攻关，探明了生物质主要糖类在亚临界水中的水解、降解、重构规律，在生物质典型单糖亚临界水预处理中的异构化、片段化和脱水等方面获得了新知识；筛选了秸秆木质纤维素降解的新功能菌株，开发了新型酶制剂；创建了沼液清液回流用于亚临界水预处理秸秆的乙醇-甲烷联产闭路循环新技术，深入研究了原料替换对闭路循环过程的影响规律。