乳酸菌是发酵食品的核心，也是食品领域问题之一。团队从我国西部地区传统发酵食品分离获得了5865株乳酸菌，从中筛选具有广谱抑菌活性、调节肠道微生态和免疫、缓解肥胖、缓解结肠炎（癌）及具有优良发酵性能的菌株，对菌株功能特性、作用机制和生产应用等方面进行了系统研究。建立了发酵食品乳酸菌菌种资源库。新发现了广谱抑菌细菌素，为细菌素家族增添了新种类。阐明了多产细菌素乳酸菌的健康机制。创建CRISPR/Cas9乳杆菌遗传操作平台。2012年至今，相关菌株及发酵技术被3家企业应用于牛羊发酵乳产品生产中，相关产品累计销售额达15亿元。同时带动了上下游产业发展，累计促进就业1000余人。项目成果发表在Journal of Agricultural and Food Chemistry, Food Chemistry, Food&Function, Food Control等期刊，研究受到国家自然科学基金、陕西省重点产业链关键核心技术“揭榜挂帅”项目、陕西省秦创原“科学家+工程师”项目和企业横向项目的支持，授权发明专利2件，培养博士研究生5人，硕士研究生16人。