环境质量是人们非常关心的问题，目前的监测规范和技术多关注化学指标。由于环境变化的效应从根本上说是对生物系统的影响，所以生物多样性相关的监测可以更直接地指示环境质量优劣。生物监测能综合地反映环境因素的联合作用，有时甚至比理化监测更敏感。目前国内的相关规范（国标、部标和地标等）吸收了一些生物监测的技术和方法，但是存在方法落后、应用争议大等问题。在主持和参与国家级、省部级和原国家海洋局重点实验室项目的基础上，对多个类群（浮游生物，底栖生物等）的水生生物多样性的监测应用进行了研究。从分类学信息、生物功能群等角度分析了水生生物在环境监测、评价以及生态修复中的作用。包括国际流行技术方法的应用比较及其在国内的实施也进行了总结。发挥统计分析和图形技术的优势，提高生物多样性监测技术的灵敏性和准确性，从生物学角度为环境质量的监测和评价提供科学依据。
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