本发明涉及种植技术领域,具体是种苗自动筛选装置,包括双层回转育苗架;双层回转育苗架包括2个框形的轨道架,2个轨道架之间滑动设置有若干个沿着轨道架框形路径等距分布的承载板台,承载板台上设置有一字排列分布的穴盘,且承载板台的一端连接有链带输送机;激光测高仪器,激光测高仪器位于轨道架的一侧;夹苗机构,夹苗机构位于轨道架的一侧;升降机构,升降机构与夹苗机构连接;横向位移机构,横向位移机构与升降机构连接;振荡机构,振荡机构与横向位移机构连接;清洗池,设置于夹苗机构的下方,本发明能够将被测高过的植株拔起后送入清洗池,再将不同高度的植株分送至不同位置,实现自动筛选种苗,便捷高效,减小人力消耗。