本发明主要涉及一种根据片段长度鉴定白花草木樨(M.albus)和黄花草木樨(M.officinalis)的特异分子标记及其专用引物。具体包括白花草木樨和黄花草木樨基因组DNA的分子标记引物试剂盒及其检测方法。一种鉴定白花草木樨和黄花草木樨的特异分子标记，其主要特点包括有：白花草木樨和黄花草木樨的PCR检测体系相同，其中包括2×Eco Taq PCR SuperMix，引物Melilotus-F(5′-3′)：GGTTCAAGTCCCTCTATC，引物Melilotus-R(5′-3′)：CTTTACCGTTTGAGCTATCC，ddH2O。鉴定结果表明，该技术具有成本低、准确度高、稳定性好和简单快捷等特点，尤其是受测群体较大时，此种方法具有更显著的经济效应。
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