本发明公开了一种利用微生物联合生物炭处理复合重金属污染的环境的方法,其包括将生物炭和锰氧化菌菌剂加入到重金属污染的环境中进行修复;锰氧化菌菌剂包括台湾假单胞菌。该方法不仅可以有效减弱重金属在土壤及水体中的迁移,还可以降低复合重金属在农作物产品中的积累,提高作物安全。其中锰氧化菌能够在生长过程中利用氧化能力生产生物氧化锰,生成的氧化锰材料与生物炭进行联合对重金属的起到钝化作用。而生物炭材料多孔疏松的结构,可为微生物提供附着点。同时该方法还能改善化学沉淀法、物理吸附法、电化学法等存在的耗能大、成本高、风险大等缺点。