本发明公开了沙打旺黄矮根腐病一对特异性分子检测引物以及利用沙打旺黄矮根腐病一对特异性分子检测引物对沙打旺是否感染沙打旺黄矮根腐病进行检测的方法。沙打旺黄矮根腐病一对特异性分子检测引物包括具有碱基序列的上游引物AatpF和下游引物AatpR,所述上游引物AatpF和下游引物AatpR是在感染沙打旺黄矮根腐病的沙打旺中特异性地扩增出135bp的产物。本发明引物特异性强、灵敏度好;本发明的检测方法通过对待检沙打旺的DNA进行扩增,可以得到135bp 的条带,对沙打旺上其他真菌DNA和沙打旺本身DNA不能扩增出任何产物,能用来快速、准确、便捷地检测沙打旺样品是否被沙打旺黄矮根腐病感染,特异型强、实用性好,对沙打旺黄矮根腐病的防治具有重要的意义。