本实用新型提出一种显微多光谱成像的食用菌菌种表型参数采集装置,包括箱体,箱体下层为暗室,暗室底部设置电动XYZ移动平台,用于放置食用菌菌种样本;暗室的后侧和两侧面分别在水平方向设置有条型LED光源,条型LED光源朝向食用菌菌种样本,用于提供不同波长的光波;箱体上层设置有单色面阵CCD相机,其相机镜头朝向显微镜模块;暗室的顶部设有显微镜模块,位于显微镜模块下面的物镜镜头朝向食用菌菌种样本;当条型LED光源提供不同光波时,单色面阵CCD相机通过显微镜模块依次拍摄多张食用菌菌种样本的单波长二维显微图像。本实用新型可提供不同波长采集环境,降低食用菌菌种表型平台制造费用。