本实用新型公开了一种草原生态系统碳通量自动测定系统,包括底座,所述底座中部的底侧安装有伺服电机,且所述伺服电机的输出端连接有丝杆,并且所述丝杆与所述底座转动连接,所述底座的左右两侧分别设置有明箱和暗箱;还包括:移动杆,螺纹连接在所述丝杆的外侧,且所述移动杆的上端安装有支撑杆,并且所述支撑杆的左右两端均滑动连接有调节块,左方位置的所述调节块的下端与所述明箱连接。该草原生态系统碳通量自动测定系统,设置有延伸架,驱动丝杆转动,可控制移动杆带动支撑杆上移,驱动明箱和暗箱上移,将延伸架从明箱和暗箱内逐渐移出,增加箱体的内部空间,使得植物顺利的生长,有利于碳通量测定的顺利进行。