本发明公开的Pd团簇催化剂的制备方法,是针对现有Pd团簇负载型催化剂中Pd团簇极易团聚为较大粒径的Pd纳米颗粒,导致Pd团簇催化剂反应活性降低的缺陷,提供了一种可将Pd团簇限域负载于有机分子笼腔体内部的方法;即首先合成有机分子笼RCC3、AT‑RCC3、FT‑RCC3,然后通过吸附钯离子、NaBH4还原的方法,限域负载Pd团簇于分子笼腔体内部,制得Pd@RCC3、Pd@AT‑RCC3、Pd@FT‑RCC3催化剂;通过有机分子笼的腔体尺寸调控Pd团簇的粒径,并间接调控催化活性。本发明所制得的Pd团簇催化剂,在催化炔醇选择性加氢合成烯醇中,炔醇转化率高于95%,烯醇选择性高于96%。本发明的方法中,所制备的Pd团簇催化剂稳定性高,其在选择性催化加氢合成烯醇中,操作易于控制,烯醇收率高,易于工业化生产。