本申请提供了M细胞靶向性重组乳酸菌疫苗及制备方法与应用,属于生物医学及生物工程领域。本申请提供的M细胞靶向性重组乳酸菌疫苗,主要将幽门螺旋杆菌多表位肽WAE连接进靶向M细胞的重组乳酸菌表面展示系统,转化进乳酸菌,制备出可防治幽门螺旋杆菌感染的重组乳酸菌疫苗。重组乳酸菌疫苗可表达含有核心组件SAM和多表位肽WAE的重组抗原SAM‑WAE,核心组件SAM可将重组抗原SAM‑WAE展示在乳酸菌表面,且将其靶向投递给胃肠道的M细胞,实现精准免疫,提高免疫效率,诱导胃肠道产生针对幽门螺旋杆菌的特异性黏膜免疫应答,起到防治幽门螺旋杆菌感染相关性胃病的目的。